La CONAMUIP esta conformada por las Coordinadoras Nacionales de los tres grupos indígenas mayoritarios de Panamá: Kuna, Emberá-Wounaan y Ngobe-Buglé.
 
1. La Organización Comarcal de Mujeres Kunas Olowaili, que trabaja al nivel de la Comarca Kuna Yala y con mujeres kunas residentes en la ciudad de Panamá.
 
2. La Coordinadora General de Mujeres Ngobe-Bugle, Organización Tradicional de las mujeres en las comunidades de las Regiones: Nurum, Kodriri, Nedriri, de la Comarca Ngobe-Buglé
 
3. La Coordinadora Comarcal de Mujeres Embera-Wounan, que trabaja en las Comarcas Emberá-Wounaan y la Región de Tierras Colectivas de la Provincia de Darién
 
 
En la actualidad, la Presidenta General de la CONAMUIP es la Señora Sonia Henríquez del Pueblo Kuna. La organización cuenta con 300 mujeres que participan como miembros activas de la organización, pero los beneficios repercuten a todas las mujeres indígenas de Panamá.

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